JCMS


Review
Recent Advances in Bioinformatics in the Medical Research Environment and Applications to the Study of Skin Diseases


A. Jamie Cuticchia

Abstract

Background: The computer has become increasingly intertwined in society for the past 30 years. Within the academic health science centre, there is an increasing need for researchers to become skilled at using the Internet as a mechanism for the retrieval of scientific results and the underlying data. The discipline of bioinformatics, which uses computer technology to provide answers to biological questions, has been expanding in scope and utility for the past decade. Increasing numbers of research groups have been investing in bioinformatics infrastructure to aid in the research process. These continuing investments have led to the establishment for the first time of a supercomputing facility within a hospital. Such computational power is being used for the mapping of genes and the study of human disease.
Objective: A discussion of the increasing role of computational biology in the research environment of the clinician scientist is pre-sented here.
Conclusions: Though the investment in a supercomputer may not be possible in most research settings, several less expensive alter-natives relying on existing desktop computers can provide supercomputer-like performance within nearly any environment.

Sommaire

Antécédents : En trente ans, l’ordinateur a largement pénétré la société. Dans le monde de la formation en sciences de la santé, les chercheurs sen-tent de plus en plus le besoin d’améliorer leur habilité à utiliser Internet pour trouver les résultats de travaux scientifiques et les données sous-jacentes. La bioinformatique, discipline qui repose sur la technologie informatique pour trouver des réponses aux questions d’ord re biologique, gagne en port é e et en utilité depuis une dizaine d’années. Un nombre croissant de groupes de recherche investissent dans une infrastructure bioinformatique pour simplifier la recherche. Ces investissements continus ont mené à la création d’une première structure mégainformatique au sein d’un hôpital. Cette puissance est employée à la cartographie (mapping) des gènes et à l’étude des maladies humaines.
Objectif: Exposer le rôle croissant de la biologie par modélisation numérique (computational biology) dans le contexte de travail du clinicien-cherc h e u r.
Conclusion: Si ce genre d’investissement reste impossible dans la plupart des établissements de recherche, il existe tout de même plusieurs solutions de rechange moins coûteuses, fondées sur les ordinateurs de bureau déjà présents, qui peuvent livrer une performance proche de la mégainforma-tique dans presque tout type de milieu.


Received 8/19/99. Accepted for publication 11/3/99.

Head, Bioinformatics, The Hospital for Sick Children, Toronto, Ontario, Canada

Reprint requests: A. Jamie Cuticchia, MD, Head of Bioinformatics, Research Institute, The Hospital for Sick Children, 555 University Ave., Toronto, ON Canada M5G 1X8

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